万年以后,一个叫霍雨浩的男孩降生了。
他的武魂是灵眸,一种精神系本体武魂。
他是帝国一名将军的私生子,将军的儿子和夫人害死了他的母亲。
他拦架喊冤,得到了帝国皇帝的同情,为自己的母亲报了仇。
将军认下了这个私生子,将他作为自己的继承人。
霍雨浩不久就展现出了惊人的魂导师天赋,皇帝为了培养他,特意送他去庚辛学院,追随九柱国之一的圣铸公爵楼嗣业学习魂导器技术。
几年后,霍雨浩学成归来,但由于先天魂力只有一,所以他只有魂导技术,却迟迟无法升阶。
皇帝任命霍雨浩为太子侍读。在太子府期间,霍雨浩认识了同为侍读的雷剑公爵之子独孤兰,在独孤兰的帮助下,霍雨浩得到了进入冰火两仪眼寻找仙草的机会。
然而,冰火两仪眼中却并没有适合霍雨浩的仙草。正在他颓废之时,冰火两仪眼底的冰火龙王呼唤了他,愿意成为他的第二、第三武魂。
没想到,霍雨浩却拒绝了,他担心冰火龙王离开之后,冰火两仪眼会枯竭。冰火龙王哈哈大笑,说这处宝地的维护只需要他们的龙骨,灵魂则可以凭依人类离开,霍雨浩这才同意以自身为容器,带冰火龙王的灵魂离开。
在冰火龙王的帮助下,霍雨浩的魂力得到了极大的进步,为武魂帝国赢下了魂师大赛的冠军,却因此遭到了日月帝国太子徐天然的忌恨,派出圣灵教准备暗杀霍雨浩。一日,霍雨浩单独出行至星斗大森林,却遇到了圣灵教袭杀。紧急之中,一团灰色气流突然出现,钻入霍雨浩体内,使得其力量瞬间暴涨,反杀了圣灵教刺客,但自身也昏迷过去。
在昏迷中,他认识了来自另一个世界的伊莱克斯,并拜他为师。
醒来后,霍雨浩发现自己被一名威严的红发男子所救。红发男子自称赤王,乃是二十万年三头赤魔獒,为光明神神官。在赤王的引导下,霍雨浩通过灵眸与光明神千寻疾相见。
千寻疾告诉他,他是这个世界上的气运之子,但他不是唯一的气运之子,在日月帝国还有一名气运之子,只不过一个是灾星,一个是福星,只有他二人能拔出命运之剑。
霍雨浩询问另一名气运之子的情况,千寻疾却避而不谈,只说在日月大陆上,有一森林名邪魔森林,居住着日月帝国护国凶兽邪眼暴君,天神千仞雪的宿敌之一便潜藏在邪魔森林之中。
霍雨浩还想再问,但千寻疾只留下一句“命运之剑是你的宿命”便抽离神念。
赤王将帝皇瑞兽、天神千仞雪养女三眼金猊千秋介绍给霍雨浩,称千秋是他的护道人,并要求霍雨浩以光明神的名义起誓不能背叛武魂帝国。霍雨浩认为皇帝对自己恩重如山,自己不可能背叛他,没必要立下光明神的证言。千秋只说是聊胜于无,霍雨浩最终还是立了誓。
武魂帝国与日月帝国互派交流生,在日月帝国皇家魂导师学院,霍雨浩认识了一名神秘的少女橘子。橘子以徐天然亲信的身份帮助他渡过了不少危机,使得霍雨浩对橘子的好感渐渐提升。与此同时,经过调查,霍雨浩发现了圣灵教的幕后黑手——罗刹魔女小舞,徐天然也只不过是小舞的傀儡。
不久后,霍雨浩回国。日月帝国交换生梦红尘痴迷女扮男装的公主千骨衣,恳求霍雨浩牵红线。霍雨浩无奈告诉其真相,梦红尘却称她不在乎男女,只是深爱千骨衣这个人。霍雨浩被其真情打动,许诺相助,但作为交换,拜托梦红尘继续调查罗刹魔女。
后两国开战,霍雨浩继承父亲之职,与橘子在战场上相见。两人在一场激烈的战斗中坠下一处极深地缝,为了生存,两人暂且联手,共同对战地下的诡异生物。在此期间,两人旧情复燃。
不料罗刹魔女小舞却突然出现,还抓来了梦红尘,以恐怖的实力将二人重伤。小舞将二人带至一处地下空洞,一把血色长剑插在一块巨石上,原来那就是命运之剑。小舞以梦红尘性命为要挟要求霍雨浩拔出命运之剑,霍雨浩无奈只能去拔剑。就在他拔出剑后,一名自称修罗神王唐三的白发男子突入霍雨浩精神之海,要夺舍霍雨浩。
唐三的灵魂精神力强大,冰火龙王都不是其对手。就在霍雨浩意识要被唐三吞噬之时,伊莱克斯以自身灵魂为代价,与唐三同归于尽。
小舞见唐三失败恼羞成怒,要将三人杀死。此刻灵魂虚弱的霍雨浩却被命运之剑上的无尽杀意所控制入魔,小舞趁机要求霍雨浩为自己效力,并称可让霍雨浩登上日月帝位,但受光明神证言影响霍雨浩无法同意。命运之剑却只想毁灭世界,操控霍雨浩向小舞攻去,但凡人之躯并非神之对手,几个回合霍雨浩的身体便濒临崩溃,命运之剑脱手而出。就在这时橘子举起命运之剑为霍雨浩挡下了小舞的致命一击,原来她便是那个灾星。橘子此刻已经明白了自己的使命,她将命运之剑刺入自己的心脏,以灾星之血洗去了命运之剑上的无尽杀意。小舞嘲笑橘子做了无谓的牺牲,就在这时千骨衣和千秋突然出现,她是追着梦红尘的气息来到此处的。小舞认为千骨衣身为天使后裔在地下作战就是送死,并且召唤邪眼暴君一同作战。然而在千秋辅助下,千骨衣爆发出了惊人的战斗力,二女几个回合便斩杀了邪眼暴君。小舞认出是千仞雪在使用神力帮助千骨衣战斗,不敢轻举妄动,双方在地下空洞中陷入了僵持。
于此同时,在地面上的战场,两位太子约定决斗。徐天然为了胜利,强迫镜红尘为自己提供了实验性魂导机甲,以代替自己残废的双腿。镜红尘认为机甲还在实验中,应该推掉决斗。徐天然却认为武魂帝国太子千骨胄只是个躲在父亲千承训阴影下的软蛋,身为封号斗罗连不可能连一个魂斗罗都打不过,自己的紫煌灭天龙才是最强武魂。
不料决斗场上,千骨胄显出自己的九个神赐魂环,在气势上压倒了徐天然。原来千骨胄才是武魂帝国第一高手,皇帝千承训患头痛病已久,在很多战斗中都是千骨胄代父亲上场。徐天然节节败退,想使用机甲的瞬移功能逃跑却怎么都无法启动,原来这套机甲早已被流亡皇子徐和做了手脚。徐天然逃命不成,被千骨胄斩杀。日月帝国军心溃散,老皇帝吐血而死。圣灵教却突然现身,掌控了日月帝国朝廷,打着为徐天然报仇的名号,派出多名邪魂师封号斗罗屠杀平民。九柱国疲于奔命,千骨胄只得暂且回师。
在地下的小舞得到了圣灵教传送的信仰之力,实力增长,打破了对峙僵局。关键时刻,霍雨浩手持命运之剑,与邪眸圣王融合。原来,霍雨浩是邪眸圣王的灵魂碎片,早在创世神战时便已丢失,经历十次转世,做十世好人,终于了却圣王当年杀戮因果,完全解放命运之力,将罗刹神与圣灵教从命运长河中彻底抹除,那些无辜死去的平民也都复活了。战斗结束,地下空洞坍塌,霍雨浩将千秋、千骨衣和梦红尘送出,自己则抱着橘子的尸体,与命运之剑一起化为点点金光消散于天地之间。
千骨衣和梦红尘震撼地看着这一幕时,一名拥有着绝世容颜的金发女子降临在二人面前。千骨衣认出这是先祖天神千仞雪,急忙按住梦红尘跪拜。千仞雪告诉二人霍雨浩并未死去,他和邪眸圣王一样,都是命运的化身,现在只不过是回归本体而已。因为命运之力归位,斗罗位面的气运也随之稳定下来,不会再有气运之子出现了。武魂和魂力也将不再受神界控制,今后人类将能找到更多的修炼方法,不只有魂环和魂骨。只有千秋连连抱怨,说自己失去命运之眼,要求千仞雪现在就带自己去神界补偿自己。
日月帝国的皇室虽然民心尽失,但日月帝国的人民却不愿意投降,推出镜红尘为首领。千骨衣带回先祖的启示,千承训决定退位并解散帝国,建立人民共和的国家,并且在原武魂帝国与日月帝国的边界上建立一座新城作为首都。他的提议得到了日月帝国人民的认可,于是在经历数千年的对立与战争后,这片大陆上再次恢复了和平。